六年級學生不二夫發(fā)現(xiàn)院子樹林里有一黃金怪人，可以瞬間變成少年和只有二十厘米高度的矮個。不久，其父親珍藏的書失竊。又不久，少年偵探團長小林被誘騙落入圈套。明智將計就計，救出小林，與少年偵探團一起協(xié)助警方搗毀了黃金怪人的巢穴。

馬戲團的演出現(xiàn)場驚現(xiàn)骷髏怪人。來歷不明的骷髏怪人頻頻滋事，將馬戲團攪得天翻地覆。同時，馬戲團長的兒子正一神秘失蹤。為了解真相，少年偵探團一路追蹤腹語術師，發(fā)現(xiàn)了驚人的秘密，一場隱藏十幾年的復仇計劃就此揭開……

惡魔的面孔突然出現(xiàn)，天空、池塘也相繼出現(xiàn)了驚人的巨臉，整個日本陷入一片恐怖的氛圍。東京監(jiān)察廳的檢察官花崎俊夫，因秉公執(zhí)法得罪了一些人，他的兩個孩子相繼被綁架。大偵探明智小五郎又一次與歹徒斗智斗勇，真相終于漸漸浮出水面……

赤坂見附公園發(fā)生了一起綁架案，嫌疑人是一個古怪的玩偶師。為了調查案件，小林芳雄男扮女裝，真由美和口袋小和尚也屢屢深陷險境。這一切的幕后黑手到底是什么人，他的目的又是什么？大偵探明智小五郎和少年偵探們能夠一一破解，取得最后的勝利嗎？

四十面相又一次越獄了，這一次，他公然宣稱要拿走神山先生收藏的倫勃朗的名畫。大偵探明智小五郎帶領少年偵探團和流浪兒別動隊與四十面相團伙連番交手，口袋小和尚大顯身手，不但破壞了四十面相的陰謀詭計，還一舉破獲了他最后的大本營——奇面城。

少年偵探團進行夜間試膽活動時，竟發(fā)現(xiàn)森林上空漂浮著一個紅眼睛、紅嘴巴的熒光腦袋。隨后，詭譎的夜光人又頻頻出現(xiàn)在東京的街頭、墓地，攪得人們戰(zhàn)戰(zhàn)兢兢，坐立不安。杉本先生家的金屬佛像、赤森先生家的白玉佛像接連失竊，真假明智小五郎輪番登場，可疑的白發(fā)老人出現(xiàn)在活動密室的出口。這意味著什么？這一切與夜光人有著怎樣的關系？明智大偵

有兩個女孩找到明智小五郎的女性助手花崎真由美，說想拜明智為師。某一天花崎帶上兩位新弟子外出，卻發(fā)現(xiàn)一座廢棄的塔樓上有一個穿著黑色披風的男人。兩名弟子落荒而逃，然而這只是某個陰謀的序幕，接下來發(fā)生了幾件更可怕的事情，他們產生了什么影響？

自稱恐怖王的大盜，時而化裝成蠟像，時而化裝成佛像，時而化裝成黃金面具人，時而化裝成假面具，鬧得東京城里雞犬不寧。小林芳雄等藏在賊車行李廂里跟蹤，卻弄巧成拙身陷囹圄，后又被大猩猩逼入采金坑道。但是他們卻因禍得福，他們到底得到了什么喃？

小學生北見菊雄偶遇一位老爺爺，并在老爺爺家見識到仿真機器人——鐵人Q。不料，鐵人Q逃跑后，不僅劫持小女孩，還搶劫銀行和珠寶店。一時間，東京城內人心惶惶。兩個少年偵探跟蹤鐵人Q，誤入一幢妖怪別墅，被扣為人質。小林和口袋小和尚設計潛入妖怪別墅，他們將如何解救同伴，破解鐵人Q之謎？

最近幾天，東京城里好多地方相繼出現(xiàn)火星人散發(fā)廣告，號召市民游覽“月球之旅”景點。大家萬萬沒有想到，這背后竟然隱藏著著一個驚天的陰謀。某夜，口袋小和尚偵察到“月球之旅”景點系某盜竊團伙的大本營。該團伙首領綁架某男孩，威脅其父交出發(fā)明專利。其父與歹徒周旋，同時小林芳雄在景點里埋設其父發(fā)明的秘密炸藥，捕獲了無所不能的帶電人M