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本書實例意在解決生物學問題，通過“編程技法”的形式，涵蓋盡可能多的組織、分析、表現(xiàn)結果的策略。在每章結尾都會有為生物研究者設計的編程題目，適合教學和自學。本書由六部分組成：Python語言基本介紹，語言所有成分介紹，高級編程，數據可視化，生物信息通用包Biopython，最后給出20個編程秘笈，范圍涵蓋了從二級結構預測、多序列比對到蛋白質三維結構的廣泛話題。此外，本書附錄還包括了大量的生物信息常用資源的信息。

　　在幾年前，編程只是計算科學工作者的特權。雖然如此，編程正加速變成生物等其他領域專家的一種需要。作為一個生物學研究者，不需要對成為一個編程專家感興趣，但是需要把編程作為多個工具中的一種來繼續(xù)科學工作�？赡茏x者已經意識到編程技巧可以大幅地加速管理和分析數據�？赡茏x者需要處理大規(guī)模的數據，多次重復某種相同的分析，或者從一個非通用格式的文件中解析數據�？梢源_信的是，在所有這些情形下，編程可以幫助你。然而，因為讀者從來沒有對“枯燥無味”和“概念艱深”的計算機科學學科有很大興趣，就可能會感到不習慣。如果是這樣的情況，這本書是適合你的。
　　本書是為那些需要更多地掌控數據，因此需要學習一些編程的生命科學工作者而寫的。目標是使得那些以前沒有編程經驗的生物科學工作者能夠自己用Python對生物數據進行分析。
　　在前言中，包括全書內容的概述及編程介紹，最后是對Python編程語言的概覽。
　　我們希望這本編程書是為生物學工作者的讀者量身定制的，能幫助分析讀者的數據，從而盡早有所收獲。
　　本書內容概述
　　本書中，讀者不僅能夠學到如何編程，還有怎樣管理數據，包括了從文件中讀取數據，分析和處理它們，把結果寫到文件中或計算機屏幕上。每個在本書中描述的單個代碼段都旨在解決生物學問題，每個例子都處理生物疑問。本書的目標是包含盡可能多的實例，覆蓋更多的組織、分析和表現(xiàn)數據的策略，用“編程秘笈”的方式來解決生物問題。在每一章后面的自測題可以用來自測或在對面向生物學工作者的編程課程上使用。
　　本書分六部分組織，共21章。第一部分介紹Python語言，如何寫第一個程序。第二部分介紹這個語言的所有基本元件，使讀者能夠獨立地寫小的程序。第三部分是關于運用技巧來創(chuàng)建組織優(yōu)良、性能高效和代碼正確的較長的程序。第四部分致力于數據可視化，可以學到如何繪制數據，或者為一篇文章或演示用的PPT文件配圖。還介紹了PyMOL，一個對大分子結構可視化的程序。第五部分介紹Biopython，它可以幫助讀寫多種生物文件格式，便捷查詢NCBI的在線數據庫，從網絡上檢索生物記錄。第六部分是一個實用手冊，包含了20個特定的“編程秘笈”，從二級結構預測和多序列聯(lián)配分析到蛋白三維結構的疊加。
　　此外，這本書還有四個附錄。附錄A提供了包括Python和UNIX命令的概覽；附錄B列出了幾個在網上免費可用的Python資源的鏈接；附錄C包含了遍布在本書中引用的樣本文件格式，例如序列的FASTA格式，序列的GenBank格式， PDB文件和MSA示例等。最后，附錄D是一個簡短的UNIX教程。
　　什么是編程
　　這本書將講授如何寫程序。程序準確地說是什么呢？一個程序在概念上類似一個菜譜。正如菜譜在開始時列出了成分和廚具一樣，

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