生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)及習(xí)題集
定 價(jià)：59 元
叢書名：生命科學(xué)與信息技術(shù)叢書
- 作者：馮世鵬 等
- 出版時(shí)間：2021/7/1
- ISBN：9787121415104
- 出 版 社：電子工業(yè)出版社
- 中圖法分類：Q811.4-33
- 頁(yè)碼：272
- 紙張：
- 版次：01
- 開(kāi)本：16開(kāi)
生物信息學(xué)是運(yùn)用生物學(xué)、數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)等多學(xué)科技術(shù)與手段進(jìn)行生物信息的獲取、存儲(chǔ)、分析、利用的一門交叉學(xué)科，是目前生物學(xué)研究的熱門領(lǐng)域之一。本書主要介紹生物信息學(xué)的相關(guān)實(shí)驗(yàn)，并給出對(duì)應(yīng)的習(xí)題。全書分為四篇：第一篇講解生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)，共設(shè)計(jì)了23個(gè)實(shí)驗(yàn)；第二篇為習(xí)題集；第三篇為習(xí)題集參考答案；第四篇提供相關(guān)的名詞解釋。本書附錄部分介紹了常見(jiàn)的模式生物和熱帶植物的主要特點(diǎn)，可供學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的讀者鞏固所學(xué)的生物信息學(xué)知識(shí)，并拓展其視野。本書的內(nèi)容主要對(duì)應(yīng)《實(shí)用生物信息學(xué)》一書，同時(shí)兼顧其他優(yōu)秀的生物信息學(xué)教材。
馮世鵬，男，博士，2009年畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院，海南大學(xué)熱帶作物學(xué)院副教授，被海南省人才服務(wù)中心認(rèn)定為拔尖人才，連續(xù)多年為研究生、本科生主講《生物信息學(xué)》課程，同時(shí)作為主講教師參與了本科生《分子生物學(xué)》、《生物化學(xué)》等課程的教學(xué)工作，教學(xué)經(jīng)驗(yàn)豐富。已出版專著一部，發(fā)表論文十余篇，申請(qǐng)專利四項(xiàng)。
目 錄
第一篇 生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn) 1
第0章 生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室規(guī)則與安全 2
第1章 文獻(xiàn)檢索 3
實(shí)驗(yàn)1 中文文獻(xiàn)檢索(以中國(guó)知網(wǎng)數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 4
實(shí)驗(yàn)2 外文文獻(xiàn)檢索(以ScienceDirect數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 8
第2章 生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)資源 12
實(shí)驗(yàn)3 核酸數(shù)據(jù)庫(kù)檢索(以GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 13
實(shí)驗(yàn)4 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索(以UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 22
實(shí)驗(yàn)5 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索(以PDB數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 30
實(shí)驗(yàn)6 基因組數(shù)據(jù)庫(kù)檢索(以TAIR數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 33
實(shí)驗(yàn)7 代謝數(shù)據(jù)庫(kù)檢索(以KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 38
實(shí)驗(yàn)8 非編碼RNA數(shù)據(jù)庫(kù)檢索(以miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 44
實(shí)驗(yàn)9 基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索(以GEO數(shù)據(jù)庫(kù)為例) 47
第3章 序列比對(duì) 50
實(shí)驗(yàn)10 在線序列比對(duì)實(shí)驗(yàn)(以BLAST、BLAT軟件為例) 50
實(shí)驗(yàn)11 本地序列比對(duì)實(shí)驗(yàn)(以BioEdit軟件為例) 54
實(shí)驗(yàn)12 多序列比對(duì)實(shí)驗(yàn)(以Clustal軟件為例) 57
第4章 核酸序列分析 61
實(shí)驗(yàn)13 核酸序列常規(guī)分析(以DNAStar軟件為例) 61
實(shí)驗(yàn)14 基因序列元件預(yù)測(cè) 63
實(shí)驗(yàn)15 引物設(shè)計(jì)分析(以Primer 5.0軟件為例) 67
實(shí)驗(yàn)16 第一代測(cè)序數(shù)據(jù)分析 71
第5章 蛋白質(zhì)序列分析 75
實(shí)驗(yàn)17 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析 75
實(shí)驗(yàn)18 蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)分析 79
實(shí)驗(yàn)19 蛋白質(zhì)的修飾分析 82
實(shí)驗(yàn)20 蛋白質(zhì)定位預(yù)測(cè) 85
第6章 基因表達(dá)分析 89
實(shí)驗(yàn)21 qPCR數(shù)據(jù)分析 89
第7章 進(jìn)化分析 93
實(shí)驗(yàn)22 進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建(以MEGA軟件為例) 93
第8章 非編碼miRNA分析 97
實(shí)驗(yàn)23 非編碼miRNA查詢及預(yù)測(cè)分析 97
第二篇 生物信息學(xué)習(xí)題集 101
第1章 文獻(xiàn)檢索 102
1.1 知識(shí)點(diǎn)介紹 102
1.2 典型例題講解 103
1.3 習(xí)題 105
第2章 生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)資源 107
2.1 知識(shí)點(diǎn)介紹 107
2.2 典型例題講解 111
2.3 習(xí)題 113
第3章 序列比對(duì) 119
3.1 知識(shí)點(diǎn)介紹 119
3.2 典型例題講解 121
3.3 習(xí)題 122
第4章 核酸序列分析 125
4.1 知識(shí)點(diǎn)介紹 125
4.2 典型例題講解 130
4.3 習(xí)題 131
第5章 蛋白質(zhì)序列分析 133
5.1 知識(shí)點(diǎn)介紹 133
5.2 典型例題講解 138
5.3 習(xí)題 139
第6章 基因表達(dá)分析 141
6.1 知識(shí)點(diǎn)介紹 141
6.2 典型例題講解 144
6.3 習(xí)題 145
第7章 進(jìn)化分析 147
7.1 知識(shí)點(diǎn)介紹 147
7.2 典型例題講解 150
7.3 習(xí)題 151
第8章 非編碼miRNA分析 153
8.1 知識(shí)點(diǎn)介紹 153
8.2 典型例題講解 156
8.3 習(xí)題 157
第三篇 參考答案 159
第1章 文獻(xiàn)檢索 160
第2章 生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)資源 163
第3章 序列比對(duì) 173
第4章 核酸序列分析 175
第5章 蛋白質(zhì)序列分析 177
第6章 基因表達(dá)分析 183
第7章 進(jìn)化分析 185
第8章 非編碼miRNA分析 186
第四篇 名詞解釋 187
附錄I 常見(jiàn)模式生物基因組信息介紹 207
附錄II 常見(jiàn)熱帶植物基因組信息介紹 240
參考資料 256
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