在這場討論的過程中，牛頓乘機(jī)更充分地說明他關(guān)于光的本性的觀點。胡克持著光是一種物質(zhì)材料的學(xué)說來責(zé)難他。事實上牛頓這時非常不喜歡較為猜測性的那類假說，他的目的是創(chuàng)造一種直接基于觀測而不含有就事物的隱藏的機(jī)制所做的一切想象的理論。“他常常，”麥克勞林說，“稱他的哲學(xué)為實驗哲學(xué)，顧名思義，它與那些僅僅是天才和虛構(gòu)的產(chǎn)物的體系之間有根本差別。”“假說，”牛頓自己說，“在實驗哲學(xué)中是不考慮的。”因此，在對胡克的批評的答復(fù)中，他斷言他關(guān)于顏色的觀點與光學(xué)過程的終極性質(zhì)的任何特殊構(gòu)思沒有任何聯(lián)系。然而，為了把它們與胡克的假設(shè)聯(lián)系起來，并確信顏色是光的固有特征，他推斷它應(yīng)該與微粒的某些確定性質(zhì)或“以太”振動相聯(lián)系。他注意到，對應(yīng)于不同顏色的微粒理應(yīng)像發(fā)出不同音高的發(fā)聲物體那樣，在“以太”中激起不同類型的振動：而“如果通過任何方法使那些不同大小的（“以太”振動）互相分離，那么最大的振動引起一種紅色感覺，最小的或最短的引起一種深紫色感覺，而中間的振動引起居間的顏色感覺。”
這句話是單色光按本性實質(zhì)上是周期性的這一原理的第一次闡明，而且周期的不同與顏色的不同相對應(yīng)。它與聲音的類似是顯然的；“很大程度上像空氣振動的方式，按照它們的不同大小，激起不同的聲音感覺。”他說，而不妨順便注意到，牛頓聯(lián)系聲音的解釋而提出的在彈性媒質(zhì)中周期振動的理論，理應(yīng)使他有資格在那些在光的理論上發(fā)揮最大影響的人中占有一席之地，即使他沒有對后一課題作出直接貢獻(xiàn)。
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